Het bestuur van de ‘Stichting ‘Zeeland 1940 – 1945 Infatuate’ stuurt het museum aan. De directe dagelijkse leiding ligt bij de beheerder van het museum. Voor de uitvoering van het beleid doet het bestuur een beroep op een veelzijdige groep vrijwilligers. Het bestuur wordt bijgestaan door het comité van aanbeveling en een aantal personen die bestuursondersteuning leveren.

De belastingdienst heeft de Stichting 'Zeeland 1940 - 1945 Infatuate' aangemerkt als Algemeen Nut Beoogende Instelling (ANBI). Dit houdt in dat het museum geeen winstoogmerk heeft en dat het van maatschappelijk nut is. Giften aan het museum zijn aftrekbaar voor de inkomsten- of vennootschapbelasting.